АБС «Сапфир» дополнена программным модулем «Взаимодействие с таможенными органами». Модуль обеспечивает, согласно положения ЦБ РФ №390-П, загрузку, обработку и ведение решений таможенного органа о приостановке операций по счетам, решений об отмене приостановки операций по счетам, а также выдачу подтверждения о получении решения таможенного органа и загрузку квитанций о результатах проверки подтверждений.